张文亮，博士，毕业于中山大学，现任广州医科大学生科院教授、博士后合作导师，
“
南山学者
”
高层次人才，广东省生物信息学会理事会副秘书长、理事，中国计算机学会生物信息学专委会、人工
智能与模式识别专业委员会和大数据专业委员会委员，广东高校科技成果转化中心专家库专家，广东
省生物化学与分子生物学学会青年委员和浙江温州市科技局专家库专家等，受邀担任广东省自然科学
基金面上项目通讯评审专家，Cell 子刊 iScience、mSystem 和 RNA Biol 等 10 余本 SCI 期刊审稿人。
长期从事生物医学组学大数据整合分析、高通量新型药物靶标筛选以及人工智能辅助疾病诊疗研
究，已独立主持国自然
/
省部级等各级项目
5
项，获授权
/
受理国家第
1
发明人专利
2
项，并取得一系列
创新性的科研成果，以第 1/通讯（含共同）作者在 Nucleic Acids Research（2022，2 篇）、Briefings in
Bioinformatics
（
2019
）、
Genomics Proteomics
＆
Bioinformatics
（
2020
）等国际知名
SCI
期刊发表论
文 10 余篇，相关成果多次受邀在国内外学术大会做报告，产生了广泛的国际影响关注。
1、Likang Zhang#, Jiahui Sun#, Sheng Liu, Wenliang Zhang*, and Jianlong Zou*. 3D culture of the
spinal cord with roots as an ex vivo model for comparative studies of motor and sensory nerve regeneration,
Experimental Neurology, 2023;362:114322..(共同通讯作者，IF=5.62, 中科院二区)
2、 Wenliang Zhang#*, Yan Zhang#, Zhuochao Min#, et al. COVID19db: a comprehensive database
platform to discover potential drugs and targets of COVID-19 at whole transcriptomic scale, Nucleic Acids
Research, 2022, 50(D1), D747-D757（第一作者和通讯作者，IF=19.16，中科院一区 TOP，Highlighted by
The Editor and The GenomeWeb media
）
3 、 Wenliang Zhang#*, Yang Liu#, Zhuochao Min#, et al. circMine: a comprehensive database to
integrate, analyze and visualize human disease related circRNA transcriptome, Nucleic Acids Research,
2022, 50(D1),D83-D92
（第一作者和通讯作者，
IF=19.16
，中科院一区
TOP
，
Highlighted by The Editor
）
4、 Wenliang Zhang, Haiyue Zhang, Huan Yang, et al. Computational resources associating diseases
with genotypes, phenotypes and exposures, Briefings in Bioinformatics, 2019, 20(6),2098-2115
（第一作者，
IF=13.9，中科院一区 TOP）
5
、
Wenliang Zhang#*,Binghui Zeng#, Huancai Lin, et al. CanImmunother:a manually curated database
for identification of cancer immunotherapies associating with biomarkers,targets, and clinical effects,
OncoImmunology, 2021, 10(1),1944553（第一作者和通讯作者，IF=8.1，中科院二区）
6
、
Wenliang Zhang#, Binghui Zeng#, Minglei Yang et al. ncRNAVar: a manually curated database for
identification and validation of noncoding RNA variants associated with human diseases, Journal of
Molecular Biology, 2021, 433(11):166727. (
第一作者
IF=6.15
，中科院二区
TOP
，
Highlighted by The
Editor）
7
、
Guocai Yao#, Wenliang Zhang#, Minglei Yang et al. MicroPhenoDB associates etagenomic data
with pathogenic microbes, microbial core genes and human disease phenotypes, Genomics, Proteomics &
Bioinformatics,2020, 18(6),760-772（共同第 1 作者，IF=7.6，中科院一区 TOP）
8
、
Wenliang Zhang, Guocai Yao, Jianbo Wang et al. ncRPheno: a comprehensive database platform for
identification and validation of disease related noncoding RNAs, RNA Biology, 2020, 17:7, 943-955（第一
作者，
IF=5.35
，中科院二区，
Cover Story)
个人主要学术科研成绩总结
姓名
张文亮
性别
男
电话
13560313976
邮箱
zhangwl25@mail3.sysu.edu.cn
南山学者类别
自然科学类
南山学者层次
骨干人才
所在二级单位
生科院
学科分类
生物学生物信息学
科研领域
生物信息学，生命组学大数据，医疗人工智能，呼吸系统疾
病与恶性肿瘤，数据库软件工具研发
2017.8 - 2020.6
，博士就读于中山大学遗传学专业
2013.8 - 2016.6
，硕士就读于中山大学生物化学与分子生物学专业
2009.9 - 2013.6，本科就读于江西农业大学生物工程专业
个人简介
工作经历
期刊论文
教育经历
1、一种 ncRNA 基因突变的解读方法、存储介质及终端，张文亮，2023（唯一发明人，已受理)
1、2021 年 10 月，荣获第十届全国生物信息学与系统生物学学术大会优秀墙报一等奖
1、人工智能辅助筛查鉴定长非编码 RNA 基因致病性突变新方法工具研究，国家自然科学基金，
2022.1-2024.12，在研，主持。
2、智能筛查鉴定致病性 MicroRNAs 基因突变新方法工具研究，广东省科技厅，2020.10-2023.9，
在研，主持。
3
、人工智能辅助筛查诊断
microRNA
基因突变相关疾病的新方法工具研究，中国博士后科学基
金委员会，
2021.6-2022.5
，已结题，主持；
4、广州医科大学高水平大学建设南山学者骨干人才启动经费，在研，2022.09-2027.09，主持。
课题组已组建了一支超 25 人的生物医学大数据挖掘和医疗人工智能研究的团队，由生物信息学、
生物医学、临床医学和计算机等专业背景的人才组成，其中包括副教授 4 名、助理教授/讲师 2 名、
博士后
6
名、外科临床医生
1
名、科研助理
1
名、研究生
4
名和本科生
10
名等。团队已配备
112
核
288
个线程，
1T RAM
，
180 T
存储的常规服务器。此外，课题组还与中山大学附属第一医院、中科
院深圳先进院高性能计算中心、香港大学深圳医院、广州实验室等相关研究团队建立了长期稳定的合
作关系，拥有丰富的临床样本数据资源和满足多组学大数据整合分析以及人工智能大数据建模研究的
高性能计算研究平台。本课题组常年招收生物信息相关研究方向的博士后和研究生，现诚邀对多组学
大数据整合分析、高通量新型药物靶标筛选以及人工智能建模研究感兴趣的有志之士加盟！课题组网
址：http://www.biomedical-web.com/omicslab/Home.html。
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