杨志凯，副教授/副研究员，2019 年获天津大学生物信息学方向博士学位，曾先后在深圳华大基因
研究院和国家人类基因组北方研究中心担任助理研究员。主要研究方向包括基因组学、生物信息学和
生物大数据。目前为止共发表
SCI
论文
20
篇，包括
Science, PNAS, Nature commutation, Molecular
Biology and Evolution, Briefings in Bioinformatics
等国际权威期刊，累计影响因子大于
210
，累计他引
近 1800 余次，其中以第一作者或通讯作者发表 SCI 论文 14 篇，单篇最高他引 260 余次，累计他引近
600 余次。受邀担任 iMeta 和 Chemosphere 等多本国际知名 SCI 学术期刊审稿人。
2012 年-2015 年，就职于深圳华大基因研究院，生物信息工程师&项目负责人
2015 年-2018 年，就职于国家人类基因组北方研究中心，助理研究员
2018 年-2019 年，就职于广东国盛医学科技有限公司，生物信息部经理
2019 年-2024 年，就职于广州医科大学，南山学者副教授/副研究员
1. Yang ZK1*, Huang XL1, Peng L1. Transcriptome analysis reveals gene expression changes of the
basidiomycetous yeast Apiotrichum mycotoxinivorans in response to ochratoxin A
exposure[J].Ecotoxicology and Environmental Safety, 2022, 246: 114146. (第 一作者 & 通讯作者 , IF:
7.1289)
2. Yang ZK1*, Li DW1, Peng L1, Liu CF, Wang ZY. Transcriptomic responses of the zearalenone
(ZEN)-detoxifying yeast Apiotrichum mycotoxinivorans to ZEN exposure[J]. Ecotoxicology and
Environmental Safety, 2022, 241: 113756. (
第一作者
&
通讯作者
, IF: 7.1289)
3. Peng L1, Liu CF1, Wu H1, Jin H, Deng XY, Zeng LT, Xiao Y, Deng C, Yang ZK*. Complete
Genome Sequencing and Comparative Analysis of the Clinically-Derived Apiotrichum mycotoxinivorans
Strain GMU1709[J]. Frontiers in cellular and infection microbiology, 2022: 46.(
通讯作者
, IF: 6.0734)
4. Yang ZK1*, Pan L1, Zhang Y1, Luo H, Gao F*. Data-driven identification of SARS-CoV-2
subpopulations using PhenoGraph and binary-coded genomic data[J]. Briefings in bioinformatics, 2021,
22(6): bbab307. (
第一作者
&
通讯作者
, IF: 13.994)
5. Yang ZK, Luo H, Zhang Y, Wang B, Gao F*. Pan-genomic analysis provides novel insights into the
association of E. coli with human host and its minimal genome[J]. Bioinformatics, 2019, 35(12): 1987-1991.
(
第一作者
, IF: 6.9307)
6. Yang ZK, Luo H, Zhang Y, Wang B, Gao F*. Recombinational DSBs-intersected genes converge on
specific disease-and adaptability-related pathways[J]. Bioinformatics, 2018, 34(20): 3421-3426.(第一作者,
IF: 6.9307)
7. Yang ZK, GaoF*. The systematic analysis of ultraconserved genomic regions in the budding
yeast[J]. Bioinformatics, 2018, 34(3): 361-366. (第一作者, IF: 6.9307)
8. Khan I1, Yang ZK1, Maldonado E, Li C, Zhang G, Gilbert MT, Jarvis ED, O'Brien SJ, Johnson WE,
Antunes A*. Olfactory receptor subgenomes linked with broad ecological adaptations in Sauropsida[J].
Molecular biology and evolution, 2015, 32(11): 2832-2843. (共同第一作者排第二, IF: 16.2404)
9. Yang ZK1, Zheng JW1, Niu YF, Yang WD, Liu JS, Li HY*. Systems-level analysis of the metabolic
responses of the diatom Phaeodactylum tricornutum to phosphorus stress[J]. Environmental microbiology,
2014, 16(6): 1793-1807. (
第一作者
, IF: 5.4760)
10. Yang ZK, Niu YF, Ma YH, Xue J, Zhang MH, Yang WD, Liu JS, Lu SH, Guan Y*, Li HY*.
Molecular and cellular mechanisms of neutral lipid accumulation in diatom following nitrogendeprivation[J].
Biotechnology for biofuels, 2013, 6(1): 1-14. (第一作者, IF: 7.6698)
姓名
杨志凯
性别
男
电话
15313865608
邮箱
yangzk@gzhmu.edu.cn
南山学者类别
自然科学类
南山学者层次
后备人才
所在二级单位
附属第五医院
学科分类
生物学
科研领域
基因组学、生物信息学、生物大数据
个人简介
工作经历
期刊论文
教育经历
1. 《Sanger 法测序中确定单核苷酸多态性的方法》，专利号：ZL201910332899.X，排名第 1。
2. 《确定微生物种类的方法和装置》，专利号：ZL201510053351.3，排名第 3。
1.《An Effective Preprocessing Method for High-Quality Pan-Genome Analysis of Bacillus subtilis and
Escherichia coli》，New York, NY : Humana Press，主要编写人员之一。
1. 基于高通量快速测序平台的未知病原检测研究与转化应用，广州市科技和信息化局 ，
2014.6-2015.6 已 结题，主持，30 万元。
2.
广州医科大学高水平大学建设南山学者后备人才启动经费，
2019.04-2024.03
，在研，主持，
100
万元。
3. α7nAChR 拮抗剂 Memantine 调控中性粒细胞活性氧-自噬途径对铜绿假单胞菌的杀菌机制，
广东省基础与应用基础研究基金委，2021.01.01-2023.12.31，在研，参与，10 万。
1. 2015 年，获南粤科技创新优秀学术论文一等奖“缺氮后硅藻中性脂质积累的分子和细胞机制”，
第 1 完成人。
2. 2015
年，获中国藻类学研究优秀论文奖二等奖“三角褐指藻对磷胁迫代谢响应的系统水平分
析”，第
1
完成人。
3. 2019 年，获“广州市高层次卫生人才医学骨干人才”称号。
4. 2013 年，获“广东省优秀硕士学位论文”提名。
本团队目前着重开展解毒毛孢酵母功能基因组学研究，同时也关注致癌性霉菌毒素（特别是赭曲
霉毒素和玉 米赤霉烯酮）与人类肿瘤的关系及预防干预策略，常年招收生化与分子生物学或生物信
息研究方向的博士 后、研究生和科研助理职位，欢迎有挑战精神的科研爱好者通过邮箱投简历，应
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